MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017305	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
2	NC_017305	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509885
3	NC_017305	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	384509885
4	NC_017305	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509885
5	NC_017305	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509885
6	NC_017305	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	384509885
7	NC_017305	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509885
8	NC_017305	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509885
9	NC_017305	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	384509885
10	NC_017305	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509885
11	NC_017305	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	384509885
12	NC_017305	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	384509885
13	NC_017305	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509885
14	NC_017305	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509885
15	NC_017305	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509885
16	NC_017305	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	384509885
17	NC_017305	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	384509885
18	NC_017305	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	384509885
19	NC_017305	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	384509885
20	NC_017305	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
21	NC_017305	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509885
22	NC_017305	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
23	NC_017305	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
24	NC_017305	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	384509885
25	NC_017305	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	384509885
26	NC_017305	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
27	NC_017305	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509885
28	NC_017305	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509885
29	NC_017305	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
30	NC_017305	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	384509885
31	NC_017305	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	384509885
32	NC_017305	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384509885
33	NC_017305	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509885
34	NC_017305	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509885
35	NC_017305	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509885
36	NC_017305	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509885
37	NC_017305	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509885
38	NC_017305	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509886
39	NC_017305	GAAG	2	8	2427	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	384509887
40	NC_017305	CCCA	2	8	2482	2489	25 %	0 %	0 %	75 %	384509887
41	NC_017305	TAC	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509887
42	NC_017305	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509887
43	NC_017305	GAT	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509887
44	NC_017305	GCT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509887
45	NC_017305	CAT	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509887
46	NC_017305	CTGC	2	8	2767	2774	0 %	25 %	25 %	50 %	384509887
47	NC_017305	GCA	3	9	2827	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509887
48	NC_017305	TC	3	6	3003	3008	0 %	50 %	0 %	50 %	384509887
49	NC_017305	GCT	2	6	3168	3173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509887
50	NC_017305	GAAA	2	8	3253	3260	75 %	0 %	25 %	0 %	384509887
51	NC_017305	CGG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509887
52	NC_017305	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509887
53	NC_017305	TTAC	2	8	3396	3403	25 %	50 %	0 %	25 %	384509887
54	NC_017305	GAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509887
55	NC_017305	TCGT	2	8	3681	3688	0 %	50 %	25 %	25 %	384509888
56	NC_017305	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509888
57	NC_017305	AT	3	6	3780	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	384509888
58	NC_017305	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509888
59	NC_017305	GTG	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509888
60	NC_017305	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509888
61	NC_017305	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509888
62	NC_017305	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509888
63	NC_017305	CGT	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509888
64	NC_017305	A	6	6	4461	4466	100 %	0 %	0 %	0 %	384509888
65	NC_017305	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509888
66	NC_017305	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509888
67	NC_017305	AAGG	2	8	4837	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	384509888
68	NC_017305	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509889
69	NC_017305	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509889
70	NC_017305	TGC	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509889
71	NC_017305	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509889
72	NC_017305	TC	3	6	4954	4959	0 %	50 %	0 %	50 %	384509889
73	NC_017305	A	6	6	5022	5027	100 %	0 %	0 %	0 %	384509889
74	NC_017305	ACG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509889
75	NC_017305	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509889
76	NC_017305	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509889
77	NC_017305	A	6	6	5184	5189	100 %	0 %	0 %	0 %	384509889
78	NC_017305	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509889
79	NC_017305	AC	3	6	5197	5202	50 %	0 %	0 %	50 %	384509889
80	NC_017305	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509889
81	NC_017305	ATAC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	384509889
82	NC_017305	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	384509890
83	NC_017305	CGG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509890
84	NC_017305	ATGC	2	8	5814	5821	25 %	25 %	25 %	25 %	384509890
85	NC_017305	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
86	NC_017305	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
87	NC_017305	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509890
88	NC_017305	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509890
89	NC_017305	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509890
90	NC_017305	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
91	NC_017305	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
92	NC_017305	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
93	NC_017305	A	6	6	6259	6264	100 %	0 %	0 %	0 %	384509890
94	NC_017305	CCGATG	2	12	6271	6282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384509890
95	NC_017305	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
96	NC_017305	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
97	NC_017305	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
98	NC_017305	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509890
99	NC_017305	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
100	NC_017305	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
101	NC_017305	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
102	NC_017305	CG	3	6	6575	6580	0 %	0 %	50 %	50 %	384509890
103	NC_017305	AAAGAA	2	12	6597	6608	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384509890
104	NC_017305	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509890
105	NC_017305	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509890
106	NC_017305	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
107	NC_017305	GGT	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509890
108	NC_017305	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509890
109	NC_017305	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
110	NC_017305	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509890
111	NC_017305	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
112	NC_017305	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509890
113	NC_017305	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509890
114	NC_017305	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509890
115	NC_017305	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509890
116	NC_017305	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
117	NC_017305	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
118	NC_017305	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509890
119	NC_017305	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509890
120	NC_017305	T	6	6	7802	7807	0 %	100 %	0 %	0 %	384509891
121	NC_017305	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509891
122	NC_017305	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509891
123	NC_017305	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509891
124	NC_017305	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509891
125	NC_017305	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509891
126	NC_017305	AT	3	6	8125	8130	50 %	50 %	0 %	0 %	384509891
127	NC_017305	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509892
128	NC_017305	GAAA	2	8	8468	8475	75 %	0 %	25 %	0 %	384509893
129	NC_017305	CTG	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
130	NC_017305	GGA	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509893
131	NC_017305	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509893
132	NC_017305	CTG	2	6	8598	8603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
133	NC_017305	TGC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
134	NC_017305	GTC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509893
135	NC_017305	GCG	2	6	8721	8726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509894
136	NC_017305	TGA	2	6	8807	8812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509894
137	NC_017305	GCT	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509894
138	NC_017305	CGA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509895
139	NC_017305	GCG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509895
140	NC_017305	GAG	2	6	9140	9145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509895
141	NC_017305	CCG	2	6	9232	9237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509895
142	NC_017305	ACG	2	6	9438	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509895
143	NC_017305	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509895
144	NC_017305	ACTC	2	8	9475	9482	25 %	25 %	0 %	50 %	384509895
145	NC_017305	TTC	2	6	9570	9575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509895
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147	NC_017305	TGA	2	6	9597	9602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509895
148	NC_017305	CAAC	2	8	9633	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	384509895
149	NC_017305	TCT	2	6	9678	9683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509895
150	NC_017305	GCAT	2	8	9728	9735	25 %	25 %	25 %	25 %	384509895
151	NC_017305	GAA	2	6	9857	9862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
152	NC_017305	CG	3	6	10044	10049	0 %	0 %	50 %	50 %	384509895
153	NC_017305	TGC	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509895
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156	NC_017305	GAA	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
157	NC_017305	CGA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509895
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159	NC_017305	AGA	2	6	10419	10424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
160	NC_017305	GAAATT	3	18	10442	10459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384509895
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162	NC_017305	ATT	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509895
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164	NC_017305	GTG	3	9	10619	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509895
165	NC_017305	CGT	2	6	10685	10690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509895
166	NC_017305	CTT	2	6	10744	10749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509895
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168	NC_017305	CG	4	8	10843	10850	0 %	0 %	50 %	50 %	384509895
169	NC_017305	AAG	2	6	10970	10975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
170	NC_017305	GGT	2	6	11009	11014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509895
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172	NC_017305	ATG	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509895
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174	NC_017305	GAA	2	6	11099	11104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509895
175	NC_017305	TGA	3	9	11128	11136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509895
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244	NC_017305	AAAG	2	8	15049	15056	75 %	0 %	25 %	0 %	384509900
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247	NC_017305	CT	3	6	15204	15209	0 %	50 %	0 %	50 %	384509900
248	NC_017305	AAG	2	6	15240	15245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509900
249	NC_017305	AGCT	2	8	15348	15355	25 %	25 %	25 %	25 %	384509900
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252	NC_017305	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	384509900
253	NC_017305	TTG	2	6	15627	15632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509900
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256	NC_017305	ATT	2	6	15685	15690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509900
257	NC_017305	CGT	2	6	15863	15868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509901
258	NC_017305	TCG	2	6	15923	15928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509901
259	NC_017305	TAC	2	6	15990	15995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509901
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261	NC_017305	TTTA	2	8	16065	16072	25 %	75 %	0 %	0 %	384509901
262	NC_017305	TGC	2	6	16160	16165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509901
263	NC_017305	GC	3	6	16296	16301	0 %	0 %	50 %	50 %	384509901
264	NC_017305	T	6	6	16307	16312	0 %	100 %	0 %	0 %	384509901
265	NC_017305	AGC	2	6	16329	16334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509901
266	NC_017305	GCA	2	6	16402	16407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509901
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270	NC_017305	CGC	2	6	16557	16562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509901
271	NC_017305	CGG	2	6	16569	16574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509901
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281	NC_017305	GGT	2	6	17227	17232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509902
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283	NC_017305	TTA	2	6	17268	17273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384509902
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291	NC_017305	TGC	2	6	17635	17640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509903
292	NC_017305	TCT	2	6	17650	17655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509903
293	NC_017305	GAG	2	6	17664	17669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509903
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362	NC_017305	AGC	3	9	21988	21996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509912
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370	NC_017305	TC	3	6	22813	22818	0 %	50 %	0 %	50 %	384509914
371	NC_017305	CGA	2	6	22833	22838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509914
372	NC_017305	CAA	2	6	22858	22863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509914
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376	NC_017305	TCC	2	6	23031	23036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509914
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378	NC_017305	T	6	6	23152	23157	0 %	100 %	0 %	0 %	384509914
379	NC_017305	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	384509914
380	NC_017305	TTGA	2	8	23236	23243	25 %	50 %	25 %	0 %	384509914
381	NC_017305	TTGTCT	2	12	23310	23321	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384509914
382	NC_017305	AAG	2	6	23383	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509914
383	NC_017305	CCAATA	2	12	23398	23409	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384509914
384	NC_017305	ACG	2	6	23471	23476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509914
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386	NC_017305	A	6	6	24107	24112	100 %	0 %	0 %	0 %	384509915
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388	NC_017305	AAT	2	6	24141	24146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509915
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